Nestle, som er verdens største producent af drikke- og fødevarer, har bragt sagen til en domstol i Mumbai. Selskabet kræver en afgørelse fra myndighederne 5. juni omstødt.
"Nestle India Limited har i dag henvendt sig til Hon'ble Bombay High Court og rejst en sag om fortolkningen af Fødevaresikkerhedsloven fra 2011," skriver selskabet.
Kenyanske supermarkeder stopper salget af Nestlés nudler
De indiske fødevaremyndigheder har efter stikprøver konkluderet, at Maggi-produktet er "risikabelt og sundhedsskadeligt for mennesker".
De meget populære Maggi-nudler, som udgør 80 procent af det enorme marked for hurtig-nudler i Indien, har været på hylderne i landet i tre årtier.
Nudelproducenten har også klaget over en anden afgørelse på delstatsniveau.
Nestle havde allerede erklæret, at man ville indstille salget af Maggi, da fødevaremyndighederne indførte et nationalt forbud, efter at flere delstater havde gjort det samme.
Det schweiziske firma har trods torsdagens klage besluttet at fortsætte det midlertidige salgsstop.
Selskabets aktier i Indien faldt mere end ni procent på børsen i Mumbai i sidste uge, da sagen kom.
Nestlé trækker populære nudler efter indisk stormvejr